नैदानिक निदान: नैदानिक निदान और उपचार में सहायता के लिए रक्त, मूत्र और अन्य जैविक नमूनों में ट्यूमर मार्करों, संक्रामक रोगजनकों, हार्मोन के स्तर आदि का पता लगाने के लिए उपयोग किया जाता है।
जैविक अनुसंधान: वैज्ञानिक अनुसंधान के क्षेत्र में, इसका उपयोग बीमारियों की घटना और विकास, बायोमार्कर की खोज और सत्यापन, सेल सिग्नलिंग आदि का अध्ययन करने के लिए किया जाता है।
दवा विकास: नई दवा विकास की प्रक्रिया में, इसका उपयोग दवा लक्ष्य, दवा मेटाबोलाइट्स आदि का पता लगाने के लिए किया जाता है।
खाद्य सुरक्षा: खाद्य सुरक्षा सुनिश्चित करने के लिए भोजन में दूषित पदार्थों, योजकों, रोगजनकों आदि का पता लगाने के लिए उपयोग किया जाता है।
पर्यावरण निगरानी: पर्यावरणीय नमूनों में हानिकारक पदार्थों, प्रदूषकों आदि का पता लगाने और पर्यावरण प्रदूषण की स्थिति का आकलन करने के लिए उपयोग किया जाता है।